Referansegruppa representerer viktige aktører og samarbeidspartnere, og skal sikre at virksomheten drives i tråd med intensjonen. Referansegruppa møtes fast to ganger i året. Gruppa vurderer og gir tilbakemelding på årsmeldingen. Den har også en rådgivningsfunksjon. Referansegruppa omfatter blant annet eksperter og fagpersoner som også kan ha en rolle i forhold til samarbeid om forskning og kompetansespredning.
Leder er Jorunn L. Helbostad fra Helse Midt-Norge. Fra de andre regionale helseforetakene kommer Bernhard Lorentzen fra Helse Sør-Øst, Cathrine Arntzen fra Helse Nord og Marianne Nielsen fra Helse Vest. Astrid Daniloff er via de regionale brukerutvalgene oppnevnt som brukerrepresentant. Ingrid Haug-Olsen fra Trondheim kommune representerer kommunehelsetjenesten. Wenche Frogn Sellæg er brukerrepresentant gjennom sitt engasjement i Nasjonalforeningen for folkehelsen.